小麦の花は、一般に穂として知られる複穂花序に配列される。穂は穂軸と穂状花序からなる。穂軸は枝分かれせずに直立し、多数の節があり、各節に1つの穂状花序をつける。
各穂状花序は2個の芒と3~9個の小花からなる。小麦の花は完全な両性花で、1個のレーマ、1個の淡蒼球、3個の雄しべ、1個の雌しべ、2個の宿便からなる。品種によって、レーマにススキがあるものとないものがある。
小麦の花の構造は、効率的な自家受粉に適応している。レーマと淡蒼球は生殖器官を囲み保護する。3本の雄しべは花粉を作り、1本の雌しべは小麦の穀粒になる可能性のある卵巣を含む。花の基部にある2つの小さな鱗片である宿根は、開花の際に膨らみ、開花に重要な役割を果たす。
小麦の開花、すなわち開花期は、平年並みの気温条件下では、通常、出穂後 3 ~ 5 日で始まる。遅咲きの小麦は頭出し後 1~2 日で開花することもあり、高温条件下では同日に開花することもある。逆に低温では、開花が頭出し後 7~8 日以上遅れることもある。
コムギの日周開花パターンは、午前中にピークを迎え、午後は活動が低下し、早朝と夕方には最小限の開花となる。このパターンから、花粉収集と人工授粉の最適なタイミング(午前中)と、母系を去勢する最適なタイミング(早朝または夕方)がわかる。
小麦の花は通常15分から20分ほど開いている。穂全体は2~3日で開花を終えるが、中には8日かかるものもある。
小麦は特定の開花順序を示す:
この連続した開花パターンは、受粉と種子着生を確実にするのに役立つ。

小麦は主に自家受粉であり、自然交雑率は通常 1% 以下である。しかし、この割合は環境条件や品種の特性によって変化する。
交雑率に影響を与える要因には、以下のようなものがある:
これらの開花・受粉特性を理解することは、小麦の育種プログラムや種子生産における遺伝的純度の維持にとって極めて重要である。限られた花粉の生存期間と自家受粉の優位性は、小麦の進化の歴史を形成し、現代の育種技術に影響を与え続けている。