Die Blüten des Weizens sind in einem zusammengesetzten Ährenblütenstand angeordnet, der gemeinhin als Ähre bezeichnet wird. Die Ähre besteht aus einer Ährenachse und Ährchen. Die Ährenachse steht ohne Verzweigung aufrecht, enthält zahlreiche Knoten und trägt an jedem Knoten ein einzelnes Ährchen.
Jedes Ährchen besteht aus 2 Hüllspelzen und 3 bis 9 Blütchen. Die Weizenblüte ist vollkommen (zweigeschlechtlich) und besteht aus einer Deckspelze, einer Fruchtblase, drei Staubblättern, einem Stempel und zwei Fruchtblättern. Je nach Sorte haben einige Sorten Grannen auf den Deckspelzen, während andere ohne Grannen sind.
Der Aufbau der Weizenblüte ist auf eine effiziente Selbstbestäubung ausgerichtet. Die Deckspelze und die Palea umschließen und schützen die Fortpflanzungsorgane. Die drei Staubblätter produzieren Pollen, während der einzige Stempel den Fruchtknoten enthält, aus dem sich ein Weizenkorn entwickeln kann. Die beiden Lodicula, kleine Schuppen an der Basis der Blüte, spielen eine entscheidende Rolle beim Öffnen der Blüte, indem sie während der Anthese anschwellen.
Die Blüte bzw. Anthese von Weizen erfolgt unter normalen Temperaturbedingungen in der Regel 3 bis 5 Tage nach dem Ährenschieben. Spät blühender Weizen kann 1 bis 2 Tage nach dem Ährenschieben blühen, bei hohen Temperaturen sogar am selben Tag. Umgekehrt können niedrige Temperaturen die Blüte um 7 bis 8 Tage oder mehr nach dem Kolbenansatz verzögern.
Die Tagesblüte von Weizen zeigt eine Spitzenaktivität am Morgen, eine geringere Aktivität am Nachmittag und eine minimale Blüte am frühen Morgen und am Abend. Dieses Muster gibt Aufschluss über den optimalen Zeitpunkt für die Pollensammlung und die künstliche Bestäubung (morgens) und die Entmannung der mütterlichen Linien (früh morgens oder abends).
Die einzelnen Weizenblüten bleiben im Allgemeinen 15 bis 20 Minuten lang geöffnet. Die gesamte Ähre ist innerhalb von 2 bis 3 Tagen mit der Blüte fertig, manche brauchen aber auch bis zu 8 Tage.
Weizen weist eine spezifische Blühfolge auf:
Dieses aufeinanderfolgende Blühmuster trägt dazu bei, die erfolgreiche Bestäubung und den Samenansatz der gesamten Pflanze sicherzustellen.

Weizen ist überwiegend selbstbestäubend, mit einer natürlichen Auskreuzungsrate von typischerweise unter 1%. Diese Rate kann jedoch je nach Umweltbedingungen und Sorteneigenschaften variieren.
Zu den Faktoren, die die Auskreuzungsrate beeinflussen, gehören:
Das Verständnis dieser Blüh- und Bestäubungseigenschaften ist für Weizenzüchtungsprogramme und die Erhaltung der genetischen Reinheit bei der Saatguterzeugung von entscheidender Bedeutung. Das begrenzte Zeitfenster für die Lebensfähigkeit der Pollen und die vorherrschende Selbstbestäubung haben die Evolutionsgeschichte des Weizens geprägt und beeinflussen auch heute noch die modernen Züchtungsverfahren.